《刺客信條：啟示錄》關鍵故事簡介（劇透）

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翻譯至官方攻略本，翻譯得一般，不過應該還是看的懂的……
啟示錄的故事跟前作一樣，是直接接着兄弟會的結束部分，得到蘋果的DESMOND在被不明力量（這裡應該就是第一文明的JUNO）的控制之下殺害了LUCY並直接崩潰，而DESMOND的同伴們將陷入崩潰狀態的他安置在一個ANIMUS裝置裏邊並運輸到一個新的目的地。
當陷入崩潰狀態的DESMOND醒來後，他發現自己在一個不知名的島嶼裏邊，而在他身邊出現了一個陌生的身影，準確地說，其實他們彼此都並不陌生，只不過DESMOND從來沒見過他的前輩——實驗體16號。實驗體16號以一個虛擬的軀體出現在DESMOND面前，並告訴他現在他在一個ANIMUS的試驗程序裏邊，而他自己（DESMOND）的記憶已經因為分別體驗了EZIO和阿泰爾的記憶而面臨破碎（記憶混亂）。實驗體16號告訴DESMOND如果他不想遭遇這種情況，他只能通過建立一個同步連接來保護他自己的意識，而這個連接可以通過他至今未見的祖先的記憶作為鑰匙來建立，當經歷了他先祖的最後時光（或者最後一個非常重要的時刻，參考EZIO最後的一個章節），ANIMUS系統和他自己被圍困的神經（BELEAGUERED SYNAPSES）會分裂為兩個額外的存在身份標記——通過此DESMOND能從昏迷中醒來。

為此DESMOND繼續回去探索EZIO的記憶，過了很多年之後，我們的刺客大師EZIO依然在為建立和平事業中奮鬥着……他依然有很多東西不明白，特別是當他得到蘋果之後第一文明所說的那個神秘的DESMOND，帶著各種各樣的疑惑和問題，他跑到了東方去調查阿泰爾建立的秘密圖書館，當他到達邁斯亞夫，被人發現身份的EZIO差點成了聖殿騎士的繩下遊魂。當他經歷千辛萬苦到達圖書館入口的時候他發現圖書館的大門被鎖起來了，而想要打開這門，EZIO必須獲得5個獨一無二的鑰匙，為此，EZIO不遠千里地跑到了君士坦丁堡。並如宿命一般遇到了土耳其國王的孫子：SULEIMAN。每當EZIO獲得一個鑰匙，他就能體驗一段阿泰爾的記憶，當他快要調查完畢的時候，SULEIMAN的舅舅：王子AHMET想通過獲得蘊藏在邁斯亞夫的秘密圖書館中的力量而帶來和平和帝國統一。在經歷了聖殿騎士的種種阻撓和順利解決AHMET王子的陰謀後，EZIO帶著5把鑰匙回到了邁斯亞夫，當他走進去那秘密圖書館，他發現裏邊壓根沒有一本書，也沒有無盡的珍貴知識，有的只有那坐在中間，孤獨等待這EZIO到來的阿泰爾的屍骨和他手上的那第六個鑰匙，當EZIO拿到最後一個鑰匙之後，他知道這根本不是什麼圖書館，這是一個儲藏室，由將死的阿泰爾和他兒子為儲存一個特殊的東西而建立並一直等待這EZIO的到來，當EZIO來到盡頭的牆壁，他發現了阿泰爾用生命最後一刻所藏起來的另外一個蘋果。這一次，EZIO沒有拿起這個蘋果，而是把它遺留在它所在的地方。蘋果突然啟動，終於明白自己角色的EZIO和DESMOND開始了穿越時空的對話，也許正如EZIO所說，「我只不過是一個一些我自己永遠都不會懂的事情的傳聲筒而已……」

儘管EZIO不能看到DESMOND，但他還是用手觸到了DESMOND的肩膀，此時，DESMOND被傳輸到一個不一樣的地方，而這次所迎接他的是第三個第一文明的人：TINIA，而他在人類眼中的角色是：宙斯。TINIA告訴DESMOND第一文明的人類曾嘗試過阻止大災難的發生，但最後他們還是沒能阻止其的發生，而此直接導致了第一文明的滅亡（刺客信條2有提到過），第一文明的三個「神」（分別是MINERVA, JUNO和TINIA）最後把他們所積累的所有知識安放在一個位置相當於現在紐約的地下寶庫裡，TINIA告訴DESMOND，他想知道的答案就安穩地躺在這個地下寶庫裏邊。